Οι Κουκλιοί είναι ένα χωριό του Πωγωνίου, στον πρώην Δήμο Άνω Καλαμά και νυν, Δήμο Πωγωνίου.
Το όνομα του χωριού συναντάται αρχικά σε καταγραφές του Αραβαντινού και του Λαμπρίδη, ως «Κουκουλιοί».
Ο Αραβαντινός για παράδειγμα, στην «Χρονογραφία της Ηπείρου» καταγράφει τους «Κουκουλιούς», στα γεγονότα των εκστρατειών κατά του Αλή Πασά.
Ο Λαμπρίδης από την άλλη, καταγράφει το όνομα στη Λάκκα Σούλι, σε οικισμό της περιοχής.
Σύμφωνα με τον Οικονόμου (2002) στα «Οικωνύμια», το όνομα του χωριού μπορεί να προέρχεται από δύο πηγές.
Η πρώτη, είναι ένα επώνυμο, κάποιος «Κουκούλης» δηλαδή. Δεν ήταν ασυνήθιστο, οικισμοί και χωριά να παίρνουν το όνομά τους από τη μεγαλύτερη ή πλουσιότερη οικογένεια της περιοχής, που κατείχε και τα περισσότερα εδάφη.
Η δεύτερη, είναι η αλβανική ρίζα kok/el που σημαίνει «κόμβος», αλλά και «θηλειά» ή «ρόζος».
Εξ ου και αρκετά παρόμοια τοπωνύμια στη Βοιωτία, καθώς επίσης και επώνυμα.
Μια τρίτη εκδοχή, την οποία πάντως ο Οικονόμου δεν συνδέει με τους Κουκλιούς, είναι από την «κουκούλα», την «καλύπτρα της κεφαλής» ή το «κωνοειδές ή σφαιροειδές επιστέγασμα» ή απλώς την τοποθεσία όπου υπάρχει μεγάλος βράχος.
Με αυτή την προέλευση, συνδέει το Κουκούλι, χωριό του Κεντρικού Ζαγορίου.